Esta subhabilidad guía la selección del pipeline Nextflow adecuado según el tipo de datos de entrada, presentando los pipelines compatibles (rnaseq 3.22.2…
Esta subhabilidad guía la selección del pipeline Nextflow adecuado según el tipo de datos de entrada, presentando los pipelines compatibles (rnaseq 3.22.2 para expresión génica, sarek 3.7.1 para llamada de variantes WGS/WES y atacseq 2.1.2 para accesibilidad de la cromatina). Establece un punto de decisión para confirmar con el usuario el pipeline elegido antes de la ejecución, mejorando la seguridad y la trazabilidad. Dispone de detección automática integrada a través de un asistente CLI (python scripts/detect_data_type.py /path/to/data) que sugiere el pipeline más adecuado, y los enlaces a la documentación específica de cada pipeline ofrecen detalles de configuración más profundos. Use esta habilidad al preparar o automatizar análisis genómicos para garantizar una selección de workflow reproducible y versionada, reducir el riesgo de mala configuración y agilizar la transición desde el descubrimiento de datos hasta la ejecución con Nextflow.
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